Eclipse 사용 도중 이러한 에러가 날 경우, workspace\.metadata 폴더에 있는 .log파일을 열어본다.
log 파일에 하기와 같은 오류가 있을 경우,

!ENTRY org.eclipse.ui.workbench 4 2 2014-03-10 10:25:38.545
!MESSAGE Problems occurred when invoking code from plug-in: "org.eclipse.ui.workbench".
!STACK 0
java.lang.NullPointerException
at org.eclipse.equinox.internal.p2.core.helpers.ServiceHelper.getService(ServiceHelper.java:74)
at org.eclipse.equinox.internal.p2.engine.SimpleProfileRegistry.updateRoamingProfile(SimpleProfileRegistry.java:156)
at org.eclipse.equinox.internal.p2.engine.SimpleProfileRegistry.updateSelfProfile(SimpleProfileRegistry.java:147)
at org.eclipse.equinox.internal.p2.engine.SimpleProfileRegistry.getProfileMap(SimpleProfileRegistry.java:344)
at org.eclipse.equinox.internal.p2.engine.SimpleProfileRegistry.internalGetProfile(SimpleProfileRegistry.java:248)
at org.eclipse.equinox.internal.p2.engine.SimpleProfileRegistry.getProfile(SimpleProfileRegistry.java:178)
at org.eclipse.equinox.internal.p2.ui.sdk.scheduler.AutomaticUpdateScheduler.earlyStartup(AutomaticUpdateScheduler.java:88)
at org.eclipse.ui.internal.EarlyStartupRunnable.runEarlyStartup(EarlyStartupRunnable.java:87)
at org.eclipse.ui.internal.EarlyStartupRunnable.run(EarlyStartupRunnable.java:66)
at org.eclipse.core.runtime.SafeRunner.run(SafeRunner.java:42)
at org.eclipse.ui.internal.Workbench$55.run(Workbench.java:2551)
at org.eclipse.core.internal.jobs.Worker.run(Worker.java:53)

이런 저런 설정들을 바꾸어 보았으나 도저히 잡히지가 않았다.
우연히 구글링을 하면서 발견한 팀.

workspace\.metadata\.plugins\org.eclipse.e4.workbench안의 xml파일을 삭제하니 정상적으로 잘 작동한다.